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El repunte de nuevos casos COVID que se experimenta desde el pasado lunes en Oaxaca aún no se refleja en el Laboratorio Estatal de Salud Pública (LESP), en donde el personal está listo para procesar el doble de pruebas PCR (Reacción en Cadena de la Polimerasa, por sus siglas en inglés) que reciben a diario.
A diferencia del mes de enero que llegaron a procesar hasta 300 pruebas PCR, la cifra promedio en abril fluctúa entre 50 y 80 diarias, pero los fines de semana la cifra disminuye a 25.
Entre este lunes y jueves en Oaxaca se notificaron 594 nuevos casos, 93 por ciento más que los 307 casos notificados entre el 29 de marzo y el 4 de abril.
De todas las unidades médicas
Desde el segundo sábado de marzo de 2020 que personal de este Laboratorio que se ubica en la agencia de Reyes Mantecón, en San Bartolo Coyotepec, identificó el virus SARS-CoV-2 en la muestra de un hombre adulto que volvió del extranjero, se han procesado más de 30 mil muestras, casi la mitad de los casos reportados en Oaxaca durante la pandemia.
La epidemia de influenza en 2009 los preparó para detectar este nuevo coronavirus y el 27 de febrero del año pasado fue de los primeros tres laboratorios estatales en tener la anuencia del Instituto de Diagnóstico y Referencia Epidemiológicos (InDRE) para identificar el virus SARS-CoV-2.
A pesar de que cuenta con 102 trabajadores, son 12 los que se encargan de procesar muestras de SARS-CoV-2, cinco contratados en esta pandemia, porque el incremento de casos en julio y enero ha requerido procesar más de 300 muestras diarias.
Cada mañana, a partir de las 8:00 horas se procesan todas las muestras que llegan el día anterior, generalmente traídas de hospitales o unidades médicas de las seis jurisdicciones sanitarias, lo que implica horas de viaje, como el que ha hecho Saúl Mayoral, oficial de transporte del Hospital de Chalcatongo de Hidalgo, a 200 kilómetros de la ciudad de Oaxaca que trajo seis muestras, cuyos resultados se enviarán de vuelta por correo electrónico.
Trabajo minucioso
De este laboratorio fundado en 1997 los 102 trabajadores, 12 se dedican a identificar el virus SARS-CoV-2, un trabajo que, después de la recepción de muestras, inicia con la extracción de material genético de cada muestra de exudado faríngeo o nasofaríngeo (mucosa que se extrae de la garganta o la fosa nasal de pacientes).
De todas las áreas, quienes trabajan en la extracción de ácidos nucleicos, como los químicos Mario Alberto Mendoza y Zuleyma Pérez Hernández, deben mantener cuidados extremos y cubrirse con bata y gorra quirúrgica, sobre las que se colocan un overol impermeable, cubre zapatos, dos pares de guantes, gafas de protección y cubrebocas KN95.
Cada uno tarda 20 minutos en ponerse el equipo de protección y otras 30 minutos para retirarlo, por eso trabajan en pares para ayudarse a quitárselo.
Con el equipo de protección trabajan en gabinetes de bioseguridad con aire que recircula y una ventana donde se puede meter las manos, pues es aquí donde se tiene contacto directo con el virus, a cuyo material genético aplican reactivos para inactivarlo y poderlo analizar.
El procesamiento es con muestras minúsculas, de 50 microlitros que equivale a 0.05 mililitros que se colocan en tubos más pequeños.
Si hubiera reactivos para el equipo mecanizado, en una hora se podrían alistar 96 muestras, pero el personal se tarda hora y media para lograr como máximo cien.
Hacer copias del virus
Después de que las muestras ya no son infectantes, se mezclan reactivos con el material genético, en gabinetes con luz ultravioleta para reducir el riesgo de infectar las muestras que terminan en un termociclador, el proceso en sí de PCR.
“Es como sacar 30 millones de fotocopias del virus para poder analizarlo”, explica el jefe del Laboratorio de Virología y Biología Molecular del Laboratorio Estatal, Luis Román Ramírez Palacios, quien resalta que la labor es tan precisa que es “casi imposible” que el SARS-CoV-2 no se detecte, “por eso a veces las muestras siguen dando positivo”, aunque el paciente ya no sea capaz de contagiar a otras personas.
Para la laboratorista clínica Virginia Margarita Velasco Aquino, el SARS-CoV-2 es una bomba cuando logra burlar los cilios, esa membrana mucosa en las fosas nasales que debería atrapar los virus para degradarlos e impedir que se repliquen dentro del cuerpo.
“Cuando los virus se replican y las células no aguantan, las revientan y se alojan principalmente en el sistema respiratorio, las secreciones aumentan y los pulmones no funcionan como debe ser, luego comienzan a fallar otros órganos”, pero no todas las personas reaccionan igual.
Ella, quien en diciembre se contagió y en febrero completó su esquema de vacunación, considera que tener COVID-19 es como lanzar una moneda al aire, “hay personas que han salido de estos y otras no”, como los 3 mil 278 decesos que se han documentado hasta el día de ayer.
Por ahora la cifra de muestras se sigue manteniendo baja.
El Doctor en Ciencias Médicas y Biológicas, Román Ramírez, cree que porque ahora hay pruebas rápidas de antígeno que están aplicando los Servicios de Salud de Oaxaca, las cuales no tienen que llegar a este laboratorio.
Aún así, “desafortunadamente por las vacaciones esperamos que en unos días los casos aumenten”.
Resultados
594 pacientes positivos a COVID-19 en cuatro días.
57% (340) detectados mediante pruebas rápidas de antígeno.
33% (194) detectados por muestras procesadas por PCR en el Laboratorio Estatal de Salud Pública.
10% (59) por asociación.
-Tanto las pruebas PCR como las de antígeno sirven para diagnosticar casos de COVID-19.
-La PCR es de uso rutinario en los laboratorios de Microbiología para detectar es un fragmento del material genético de un patógeno o microorganismo como el SARS-CoV-2.
-Puede diferenciar entre dos microorganismos muy cercanos evolutivamente.
-Detecta el virus en las primeras fases respiratorias.
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